Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Strn4P58404 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Strn4P58404 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Strn4P58404 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Strn4P58404 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Strn4P58404 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Strn4P58404 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Strn4P58404 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Strn4P58404 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Strn4P58404 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Strn4P58404 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Strn4P58404 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Strn4P58404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Strn4P58404 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Strn4P58404 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Strn4P58404 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Strn4P58404 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Strn4P58404 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Strn4P58404 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Strn4P58404 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Strn4P58404 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Strn4P58404 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Strn4P58404 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms