Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp25P57080 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp25P57080 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp25P57080 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp25P57080 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp25P57080 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp25P57080 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp25P57080 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp25P57080 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp25P57080 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp25P57080 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp25P57080 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp25P57080 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp25P57080 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp25P57080 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp25P57080 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms