Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FusP56959 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FusP56959 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FusP56959 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FusP56959 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FusP56959 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FusP56959 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FusP56959 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FusP56959 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FusP56959 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FusP56959 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FusP56959 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FusP56959 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FusP56959 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FusP56959 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FusP56959 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FusP56959 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FusP56959 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FusP56959 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FusP56959 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FusP56959 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FusP56959 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FusP56959 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FusP56959 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FusP56959 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FusP56959 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FusP56959 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FusP56959 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FusP56959 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FusP56959 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FusP56959 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FusP56959 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FusP56959 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FusP56959 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FusP56959 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FusP56959 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FusP56959 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FusP56959 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FusP56959 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FusP56959 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FusP56959 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FusP56959 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FusP56959 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FusP56959 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FusP56959 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FusP56959 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FusP56959 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FusP56959 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FusP56959 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FusP56959 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FusP56959 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FusP56959 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FusP56959 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FusP56959 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FusP56959 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FusP56959 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms