Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd5P56812 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcd5P56812 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd5P56812 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pdcd5P56812 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcd5P56812 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Pdcd5P56812 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pdcd5P56812 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms