Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf5P56477 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf5P56477 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf5P56477 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irf5P56477 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irf5P56477 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irf5P56477 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irf5P56477 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Irf5P56477 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Irf5P56477 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irf5P56477 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irf5P56477 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irf5P56477 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Irf5P56477 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irf5P56477 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms