Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NcanP55066 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NcanP55066 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NcanP55066 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NcanP55066 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NcanP55066 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NcanP55066 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NcanP55066 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NcanP55066 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NcanP55066 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NcanP55066 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NcanP55066 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NcanP55066 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NcanP55066 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NcanP55066 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NcanP55066 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NcanP55066 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NcanP55066 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NcanP55066 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NcanP55066 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NcanP55066 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NcanP55066 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NcanP55066 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NcanP55066 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NcanP55066 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NcanP55066 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NcanP55066 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NcanP55066 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NcanP55066 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NcanP55066 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NcanP55066 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NcanP55066 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NcanP55066 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcanP55066 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcanP55066 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcanP55066 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NcanP55066 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NcanP55066 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NcanP55066 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NcanP55066 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NcanP55066 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NcanP55066 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NcanP55066 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NcanP55066 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NcanP55066 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NcanP55066 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NcanP55066 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NcanP55066 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NcanP55066 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NcanP55066 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NcanP55066 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NcanP55066 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NcanP55066 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NcanP55066 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NcanP55066 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NcanP55066 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcanP55066 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcanP55066 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcanP55066 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NcanP55066 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NcanP55066 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NcanP55066 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NcanP55066 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NcanP55066 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NcanP55066 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NcanP55066 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NcanP55066 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NcanP55066 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NcanP55066 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NcanP55066 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NcanP55066 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NcanP55066 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NcanP55066 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NcanP55066 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NcanP55066 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NcanP55066 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NcanP55066 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcanP55066 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcanP55066 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcanP55066 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcanP55066 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NcanP55066 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NcanP55066 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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