Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acod1P54987 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acod1P54987 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acod1P54987 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acod1P54987 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acod1P54987 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acod1P54987 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acod1P54987 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acod1P54987 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acod1P54987 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acod1P54987 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acod1P54987 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acod1P54987 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms