Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Faf1P54731 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Faf1P54731 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Faf1P54731 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Faf1P54731 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faf1P54731 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf1P54731 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Faf1P54731 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Faf1P54731 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Faf1P54731 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf1P54731 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf1P54731 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf1P54731 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf1P54731 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Faf1P54731 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf1P54731 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf1P54731 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Faf1P54731 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Faf1P54731 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms