Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lbx1P52955 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lbx1P52955 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lbx1P52955 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lbx1P52955 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lbx1P52955 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lbx1P52955 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms