Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClgnP52194 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClgnP52194 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClgnP52194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClgnP52194 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClgnP52194 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClgnP52194 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ClgnP52194 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ClgnP52194 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ClgnP52194 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ClgnP52194 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms