Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc1a1P51906 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc1a1P51906 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc1a1P51906 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc1a1P51906 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc1a1P51906 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc1a1P51906 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms