Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CntfP51642 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CntfP51642 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CntfP51642 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CntfP51642 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CntfP51642 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CntfP51642 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CntfP51642 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CntfP51642 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CntfP51642 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CntfP51642 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CntfP51642 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CntfP51642 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CntfP51642 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CntfP51642 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CntfP51642 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CntfP51642 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CntfP51642 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CntfP51642 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CntfP51642 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CntfP51642 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CntfP51642 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CntfP51642 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CntfP51642 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CntfP51642 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CntfP51642 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CntfP51642 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntfP51642 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntfP51642 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntfP51642 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntfP51642 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CntfP51642 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntfP51642 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntfP51642 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntfP51642 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntfP51642 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CntfP51642 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CntfP51642 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CntfP51642 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CntfP51642 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CntfP51642 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CntfP51642 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntfP51642 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntfP51642 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CntfP51642 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CntfP51642 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntfP51642 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntfP51642 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CntfP51642 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CntfP51642 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntfP51642 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntfP51642 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntfP51642 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CntfP51642 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntfP51642 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CntfP51642 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntfP51642 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntfP51642 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CntfP51642 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntfP51642 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntfP51642 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntfP51642 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CntfP51642 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntfP51642 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntfP51642 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CntfP51642 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntfP51642 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntfP51642 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntfP51642 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntfP51642 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CntfP51642 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms