Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TspoP50637 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TspoP50637 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TspoP50637 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TspoP50637 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TspoP50637 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TspoP50637 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TspoP50637 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TspoP50637 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TspoP50637 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TspoP50637 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TspoP50637 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TspoP50637 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TspoP50637 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TspoP50637 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TspoP50637 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TspoP50637 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TspoP50637 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TspoP50637 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TspoP50637 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TspoP50637 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TspoP50637 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TspoP50637 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TspoP50637 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TspoP50637 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TspoP50637 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TspoP50637 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TspoP50637 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TspoP50637 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TspoP50637 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TspoP50637 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TspoP50637 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TspoP50637 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TspoP50637 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TspoP50637 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TspoP50637 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TspoP50637 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TspoP50637 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TspoP50637 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TspoP50637 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TspoP50637 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TspoP50637 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TspoP50637 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TspoP50637 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TspoP50637 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TspoP50637 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TspoP50637 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TspoP50637 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TspoP50637 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TspoP50637 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TspoP50637 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TspoP50637 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TspoP50637 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TspoP50637 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TspoP50637 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TspoP50637 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TspoP50637 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TspoP50637 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TspoP50637 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TspoP50637 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TspoP50637 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TspoP50637 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TspoP50637 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TspoP50637 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TspoP50637 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TspoP50637 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TspoP50637 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TspoP50637 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TspoP50637 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TspoP50637 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TspoP50637 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TspoP50637 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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