Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcls1P49710 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcls1P49710 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcls1P49710 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hcls1P49710 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hcls1P49710 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms