Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcntP48725 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcntP48725 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcntP48725 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PcntP48725 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcntP48725 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcntP48725 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcntP48725 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PcntP48725 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PcntP48725 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PcntP48725 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PcntP48725 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PcntP48725 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PcntP48725 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PcntP48725 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcntP48725 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcntP48725 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcntP48725 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcntP48725 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcntP48725 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcntP48725 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PcntP48725 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PcntP48725 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PcntP48725 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PcntP48725 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcntP48725 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcntP48725 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcntP48725 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcntP48725 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcntP48725 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcntP48725 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcntP48725 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcntP48725 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PcntP48725 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PcntP48725 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PcntP48725 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PcntP48725 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PcntP48725 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PcntP48725 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PcntP48725 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PcntP48725 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PcntP48725 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PcntP48725 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PcntP48725 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PcntP48725 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PcntP48725 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PcntP48725 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PcntP48725 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PcntP48725 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PcntP48725 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PcntP48725 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PcntP48725 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PcntP48725 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PcntP48725 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PcntP48725 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PcntP48725 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PcntP48725 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PcntP48725 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PcntP48725 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PcntP48725 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcntP48725 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcntP48725 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PcntP48725 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PcntP48725 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PcntP48725 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PcntP48725 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PcntP48725 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PcntP48725 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PcntP48725 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PcntP48725 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PcntP48725 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PcntP48725 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PcntP48725 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcntP48725 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcntP48725 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcntP48725 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcntP48725 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PcntP48725 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PcntP48725 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PcntP48725 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PcntP48725 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PcntP48725 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PcntP48725 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PcntP48725 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PcntP48725 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PcntP48725 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PcntP48725 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PcntP48725 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms