Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VdrP48281 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VdrP48281 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VdrP48281 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VdrP48281 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VdrP48281 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VdrP48281 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VdrP48281 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VdrP48281 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VdrP48281 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VdrP48281 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VdrP48281 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VdrP48281 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VdrP48281 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VdrP48281 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VdrP48281 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VdrP48281 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VdrP48281 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VdrP48281 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VdrP48281 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VdrP48281 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VdrP48281 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VdrP48281 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VdrP48281 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VdrP48281 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VdrP48281 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VdrP48281 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VdrP48281 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VdrP48281 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VdrP48281 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VdrP48281 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VdrP48281 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VdrP48281 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VdrP48281 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VdrP48281 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VdrP48281 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VdrP48281 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VdrP48281 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VdrP48281 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VdrP48281 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VdrP48281 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VdrP48281 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VdrP48281 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VdrP48281 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VdrP48281 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VdrP48281 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VdrP48281 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VdrP48281 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VdrP48281 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VdrP48281 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VdrP48281 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VdrP48281 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VdrP48281 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VdrP48281 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VdrP48281 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VdrP48281 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VdrP48281 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VdrP48281 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VdrP48281 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VdrP48281 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VdrP48281 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VdrP48281 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VdrP48281 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VdrP48281 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VdrP48281 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VdrP48281 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VdrP48281 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VdrP48281 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VdrP48281 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VdrP48281 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VdrP48281 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VdrP48281 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VdrP48281 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms