Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scg3P47867 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg3P47867 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg3P47867 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg3P47867 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg3P47867 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg3P47867 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg3P47867 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg3P47867 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg3P47867 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg3P47867 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg3P47867 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg3P47867 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg3P47867 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg3P47867 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms