Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfkmP47857 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PfkmP47857 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PfkmP47857 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PfkmP47857 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PfkmP47857 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfkmP47857 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfkmP47857 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PfkmP47857 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PfkmP47857 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfkmP47857 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfkmP47857 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PfkmP47857 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PfkmP47857 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PfkmP47857 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfkmP47857 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PfkmP47857 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PfkmP47857 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms