Protein–RNA interactions for Protein: P43136

Nr2f6, Nuclear receptor subfamily 2 group F member 6, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f6P43136 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f6P43136 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f6P43136 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f6P43136 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f6P43136 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f6P43136 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr2f6P43136 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr2f6P43136 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms