Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdf5P43027 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdf5P43027 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdf5P43027 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gdf5P43027 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf5P43027 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf5P43027 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gdf5P43027 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gdf5P43027 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdf5P43027 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms