Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pbx1P41778 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pbx1P41778 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pbx1P41778 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pbx1P41778 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbx1P41778 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbx1P41778 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms