Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox7P40646 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox7P40646 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sox7P40646 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sox7P40646 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox7P40646 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox7P40646 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox7P40646 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox7P40646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox7P40646 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox7P40646 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms