Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf2P39429 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf2P39429 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Traf2P39429 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Traf2P39429 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Traf2P39429 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf2P39429 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf2P39429 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf2P39429 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf2P39429 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf2P39429 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf2P39429 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf2P39429 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms