Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Traf1P39428 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Traf1P39428 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Traf1P39428 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Traf1P39428 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Traf1P39428 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Traf1P39428 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Traf1P39428 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Traf1P39428 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Traf1P39428 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Traf1P39428 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Traf1P39428 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Traf1P39428 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Traf1P39428 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms