Protein–RNA interactions for Protein: P35917

Flt4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt4P35917 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Flt4P35917 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt4P35917 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Flt4P35917 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Flt4P35917 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Flt4P35917 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt4P35917 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Flt4P35917 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Flt4P35917 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Flt4P35917 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Flt4P35917 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Flt4P35917 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Flt4P35917 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Flt4P35917 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Flt4P35917 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Flt4P35917 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Flt4P35917 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Flt4P35917 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Flt4P35917 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms