Protein–RNA interactions for Protein: P35761

Ttk, Dual specificity protein kinase TTK, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtkP35761 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtkP35761 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtkP35761 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtkP35761 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TtkP35761 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TtkP35761 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TtkP35761 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtkP35761 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TtkP35761 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtkP35761 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtkP35761 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtkP35761 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TtkP35761 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtkP35761 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtkP35761 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtkP35761 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtkP35761 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TtkP35761 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtkP35761 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtkP35761 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtkP35761 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtkP35761 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TtkP35761 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TtkP35761 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TtkP35761 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtkP35761 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtkP35761 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtkP35761 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TtkP35761 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtkP35761 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtkP35761 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtkP35761 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtkP35761 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TtkP35761 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtkP35761 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TtkP35761 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TtkP35761 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtkP35761 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtkP35761 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtkP35761 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TtkP35761 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TtkP35761 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TtkP35761 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtkP35761 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtkP35761 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtkP35761 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TtkP35761 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TtkP35761 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtkP35761 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TtkP35761 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtkP35761 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TtkP35761 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TtkP35761 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TtkP35761 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TtkP35761 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TtkP35761 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TtkP35761 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TtkP35761 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtkP35761 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TtkP35761 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtkP35761 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TtkP35761 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TtkP35761 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TtkP35761 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TtkP35761 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TtkP35761 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TtkP35761 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtkP35761 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtkP35761 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtkP35761 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtkP35761 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TtkP35761 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtkP35761 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtkP35761 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtkP35761 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TtkP35761 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtkP35761 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TtkP35761 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtkP35761 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtkP35761 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TtkP35761 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtkP35761 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TtkP35761 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtkP35761 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtkP35761 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TtkP35761 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtkP35761 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtkP35761 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TtkP35761 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms