Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab20P35295 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab20P35295 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab20P35295 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab20P35295 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab20P35295 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab20P35295 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab20P35295 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab20P35295 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab20P35295 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab20P35295 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab20P35295 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab20P35295 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab20P35295 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab20P35295 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab20P35295 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms