Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab17P35292 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab17P35292 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab17P35292 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab17P35292 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab17P35292 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rab17P35292 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab17P35292 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab17P35292 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab17P35292 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms