Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ptpn11P35235 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptpn11P35235 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptpn11P35235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ptpn11P35235 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptpn11P35235 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms