Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ifnar1P33896 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ifnar1P33896 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ifnar1P33896 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Ifnar1P33896 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ifnar1P33896 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ifnar1P33896 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ifnar1P33896 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms