Protein–RNA interactions for Protein: P33434

Mmp2, 72 kDa type IV collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp2P33434 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mmp2P33434 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mmp2P33434 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mmp2P33434 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mmp2P33434 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mmp2P33434 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp2P33434 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms