Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprmP28828 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprmP28828 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprmP28828 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PtprmP28828 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprmP28828 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprmP28828 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprmP28828 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprmP28828 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprmP28828 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PtprmP28828 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PtprmP28828 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprmP28828 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprmP28828 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PtprmP28828 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PtprmP28828 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PtprmP28828 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprmP28828 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprmP28828 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PtprmP28828 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PtprmP28828 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
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