Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Col2a1P28481 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col2a1P28481 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col2a1P28481 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Col2a1P28481 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Col2a1P28481 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms