Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja4P28235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja4P28235 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gja4P28235 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja4P28235 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja4P28235 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja4P28235 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja4P28235 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja4P28235 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja4P28235 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja4P28235 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja4P28235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja4P28235 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja4P28235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja4P28235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms