Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,98■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,97■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,97■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,96■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,94■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17,92■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17,92■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17,9■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,9■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,89■□□□□ 0,46
Ccl6P27784 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17,88■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17,83■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,45
Ccl6P27784 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17,83■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,81■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17,8■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,78■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Ccl6P27784 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,8 ms