Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfrsf1bP25119 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfrsf1bP25119 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf1bP25119 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf1bP25119 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf1bP25119 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf1bP25119 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms