Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria2P23819 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria2P23819 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gria2P23819 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria2P23819 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gria2P23819 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gria2P23819 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gria2P23819 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gria2P23819 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gria2P23819 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gria2P23819 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gria2P23819 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria2P23819 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria2P23819 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gria2P23819 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gria2P23819 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms