Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria1P23818 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gria1P23818 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gria1P23818 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria1P23818 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gria1P23818 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria1P23818 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gria1P23818 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gria1P23818 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria1P23818 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gria1P23818 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria1P23818 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria1P23818 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria1P23818 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gria1P23818 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gria1P23818 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gria1P23818 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gria1P23818 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gria1P23818 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gria1P23818 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gria1P23818 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms