Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Xrcc6P23475 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Xrcc6P23475 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xrcc6P23475 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Xrcc6P23475 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xrcc6P23475 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms