Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gja1P23242 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gja1P23242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja1P23242 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gja1P23242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja1P23242 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja1P23242 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja1P23242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gja1P23242 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja1P23242 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja1P23242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja1P23242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja1P23242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja1P23242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja1P23242 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja1P23242 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms