Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RarbP22605 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RarbP22605 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RarbP22605 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RarbP22605 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RarbP22605 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RarbP22605 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RarbP22605 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RarbP22605 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RarbP22605 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RarbP22605 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RarbP22605 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RarbP22605 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RarbP22605 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RarbP22605 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RarbP22605 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RarbP22605 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RarbP22605 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RarbP22605 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RarbP22605 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RarbP22605 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RarbP22605 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RarbP22605 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RarbP22605 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RarbP22605 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RarbP22605 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RarbP22605 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RarbP22605 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RarbP22605 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RarbP22605 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RarbP22605 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RarbP22605 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RarbP22605 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RarbP22605 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RarbP22605 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RarbP22605 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RarbP22605 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RarbP22605 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RarbP22605 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RarbP22605 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RarbP22605 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RarbP22605 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RarbP22605 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RarbP22605 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RarbP22605 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RarbP22605 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RarbP22605 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RarbP22605 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RarbP22605 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RarbP22605 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RarbP22605 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RarbP22605 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RarbP22605 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RarbP22605 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RarbP22605 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RarbP22605 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RarbP22605 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RarbP22605 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RarbP22605 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RarbP22605 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RarbP22605 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RarbP22605 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RarbP22605 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RarbP22605 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RarbP22605 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RarbP22605 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RarbP22605 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RarbP22605 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RarbP22605 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RarbP22605 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RarbP22605 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RarbP22605 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RarbP22605 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RarbP22605 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RarbP22605 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RarbP22605 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RarbP22605 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RarbP22605 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RarbP22605 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RarbP22605 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RarbP22605 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RarbP22605 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RarbP22605 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RarbP22605 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RarbP22605 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RarbP22605 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RarbP22605 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RarbP22605 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RarbP22605 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms