Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BdnfP21237 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BdnfP21237 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BdnfP21237 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BdnfP21237 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BdnfP21237 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BdnfP21237 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BdnfP21237 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BdnfP21237 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BdnfP21237 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BdnfP21237 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BdnfP21237 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BdnfP21237 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms