Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt19P19001 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt19P19001 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt19P19001 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt19P19001 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt19P19001 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt19P19001 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt19P19001 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt19P19001 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt19P19001 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt19P19001 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt19P19001 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms