Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcna1P16388 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcna1P16388 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kcna1P16388 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcna1P16388 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcna1P16388 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Kcna1P16388 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcna1P16388 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms