Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChgbP16014 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChgbP16014 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChgbP16014 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChgbP16014 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChgbP16014 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChgbP16014 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChgbP16014 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChgbP16014 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChgbP16014 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChgbP16014 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChgbP16014 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChgbP16014 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgbP16014 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgbP16014 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChgbP16014 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChgbP16014 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgbP16014 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgbP16014 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgbP16014 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgbP16014 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms