Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrphP15331 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PrphP15331 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrphP15331 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PrphP15331 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrphP15331 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrphP15331 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrphP15331 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PrphP15331 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrphP15331 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrphP15331 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrphP15331 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrphP15331 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrphP15331 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrphP15331 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrphP15331 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrphP15331 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrphP15331 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrphP15331 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrphP15331 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrphP15331 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrphP15331 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrphP15331 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrphP15331 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrphP15331 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrphP15331 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrphP15331 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrphP15331 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrphP15331 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrphP15331 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PrphP15331 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrphP15331 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrphP15331 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PrphP15331 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrphP15331 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PrphP15331 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrphP15331 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrphP15331 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrphP15331 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PrphP15331 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PrphP15331 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PrphP15331 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrphP15331 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrphP15331 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrphP15331 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrphP15331 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PrphP15331 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrphP15331 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PrphP15331 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PrphP15331 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrphP15331 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrphP15331 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PrphP15331 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PrphP15331 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PrphP15331 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PrphP15331 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrphP15331 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PrphP15331 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrphP15331 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrphP15331 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PrphP15331 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrphP15331 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrphP15331 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrphP15331 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PrphP15331 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrphP15331 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PrphP15331 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrphP15331 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrphP15331 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PrphP15331 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrphP15331 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PrphP15331 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PrphP15331 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrphP15331 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrphP15331 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrphP15331 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrphP15331 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PrphP15331 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrphP15331 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PrphP15331 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrphP15331 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PrphP15331 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms