Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srp54P14576 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54P14576 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srp54P14576 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srp54P14576 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54P14576 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srp54P14576 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54P14576 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srp54P14576 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54P14576 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms