Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb2P13373 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb2P13373 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vpreb2P13373 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms