Protein–RNA interactions for Protein: P11881

Itpr1, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr1P11881 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itpr1P11881 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itpr1P11881 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itpr1P11881 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itpr1P11881 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itpr1P11881 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itpr1P11881 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms