Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd1d1P11609 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd1d1P11609 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd1d1P11609 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms